Matt Dillon egy titkosszolgálati ügynök szerepében két eltűnt szövetségi ügynök felkutatására indul, a nyomozása azonban újabb és újabb kérdéseket vet fel. Minden egyes kérdéssel közelebb kerül a legfontosabb kérdéshez: Mi az, ami nem stimmel Wayward Pines-szal?